告谋反，给魏忠贤建祠堂之类的东西，可能都有，但问题是，边军谁没有？
毛文龙当辽事破坏之后，从岛中收召辽人，牵制金、复、海、盖，时时袭虏，有所斩获，颇有功。而辽民苦虐于北，时欲窜归中朝，归路甚艰，百计疾走，数日夜防抵关，文龙必掩杀之，以充虏报功，是以大恶。又骄恣，所上事多浮夸，索饷又过多，朝论多疑而厌之者。以其握重兵，又居海岛中，莫能难也。这些拿来指控毛文龙的罪证都很奇葩。
前面才说招收辽人，后面又掩杀之，前后矛盾。
倒是关于毛文龙和袁可立交往的很多史料是可信的，这也是后世满清会将袁可立这么重要的历史人物，完全从史书上抹去的原因。
奴酋逆天顺犯，于今七载。赖毛帅倡义，屡获奇捷，大张挞伐之气。据所报功级解验，前后大小三十余战，斩首共一千九十七级数逾，上捷者共五次，总获器械、弓箭等件共五万。当我圣主宵旰之时，人心危惧之日，海外有此奇功，其应陛应赏应恤之官兵相应敕部，行巡按御史覆勘，再为议序，以候俞旨施行。
袁可立作为登莱巡抚，毛文龙最好的上级，虽然毛文龙并不怎么领情，但袁可立和孙承宗对朝廷说的关于毛文龙的事，大部分是好话，