东采取军卫管理体制，李永芳也就是抚顺的最高长官。1613年（万历四十一年），努尔哈赤攻克乌喇部，乌喇部贝勒布占泰逃往叶赫。
努尔哈赤又征讨叶赫，叶赫部向明朝求援。
后来，明朝遣使告诫努尔哈赤，不许他侵犯叶赫。努尔哈赤修书给明朝，表示叶赫背盟悔婚，藏匿布占泰，自己是不得已而用兵，并亲自前往抚顺千户所。
李永芳出迎三里，将努尔哈赤引入教场。努尔哈赤将回书交给李永芳，拒绝赴李永芳所设之宴就率军返回。
1614年（万历四十二年），明朝加强抚顺边防，将李永芳的军衔由备御升至游击。
1618年（后金天命三年）四月，努尔哈赤入侵明朝，围困抚顺，并致书给李永芳道：“明朝发兵帮助叶赫，我才率军来攻，你只是一个游击，能够战胜我吗？你很有才智，识时务，我国正需人才，像你这种人才我怎能不加以重用？你要是想战的话，我军弓箭可不认识你。你若出降，我便保城中百姓安宁。你不要以为我在吓唬你，我若连你这区区一城都打不下，还出什么兵？降不降，你好好考虑。”
李永芳看完书信后，便登上南门请降，但仍命士卒准备防御战具。后金军以云梯攻城，很快就