怪家伙是有什么目的柯南，在和小兰以及园子去医院看她们的同学绚子意外遇到最近从他视线里消失的本堂瑛佑后，立马又警惕了起来。
丝毫不懂得反省他自己当时借宿在毛利家也不是什么单纯借住，而是怀着调查黑衣组织目的这种凶险主线任务的柯南，在好基友服部平次很是巧合的提供了本堂瑛佑和他父亲的信息以及表示自己对水无怜奈这个女人一无所获后。
对于本堂瑛佑这个神 神 秘秘，可能还和黑衣组织的成员水无怜奈是姐弟关系，而且经过他的调查，发现本堂瑛佑那个据说在国外的父亲，也不是什么简单货色后。
没有办法接触那两个人的柯南立马将本堂瑛佑列为了自己的头号目标。在打击黑衣组织这个宿敌上，柯南可是一直相当有攻击欲望的。即使对方杀死他就和捏死一只蚂蚁一样简单，他也没有怂过。
于是围绕本堂瑛佑和水无怜奈到底是什么关系，而他那个神 秘的父亲又到底是不是黑衣组织成员这些问题，柯南这几天可是相当活跃。
甚至为了多一些接触本堂瑛佑的机会，他还怂恿毛利小五郎找这个他最讨厌的对手来给毛利小五郎当助手破案。
可惜，对于这种乱七八糟的麻烦，丝毫不想沾惹的毛利