第二部，第三部的剧情。
分别是万磁王抓捕罗莎女，试图用一个十分不靠谱的机器将全人类变成变种人，以及史崔克利用他的儿子幻想大师，引起变种人与人类的战争，最终凤凰女琴葛蕾因为阻挡洪水而牺牲，还有解药变种人水蛭的诞生，引起了变种人的内战这三段剧情。
内战结束之后，变种人似乎安静了一段时间，但就在这个时候，哨兵机器人横空出世。
这时，变种人们才惊觉，原来魔形女在一九七三年被抓住之后，虽然逃了出来，但血液和基因却被留在了特拉斯工业。
因为玻利瓦尔特拉斯遇刺，人类对于变种人一直处于防备阶段，暗中研究哨兵机器人这个大杀器。
魔形女的基因补全了哨兵机器人的最后一块拼图，当哨兵机器人横空出世的时候，无论是人类还是变种人，都无法阻拦它们。
世界濒临毁灭。
老牌变种人逐渐牺牲，在最后时刻，查尔斯提出用幻影猫凯蒂的能力将金刚狼罗根的思维送回一九七三年，让他阻止瑞文，阻止这一切，逆转未来。
这，就是分歧点。
毫无疑问，罗根成功了。
一九七三年瑞文刺杀失败，玻利瓦尔特拉斯没有