渐渐地发展成为了一个严密的地下组织，有专门的培训基地提供人才，而“伊贺忍者村”正是这样的培训基地。
匿名者里日本的“伊贺忍者村”只是负责训练“调查兵团”与“刺杀兵团”。英国的“摩萨德”是负责培训“护卫军团”和“后勤军团”的。而最大的培训地在美国的“林肯基地”那里四种兵团的人都有培训。
一开始零在“伊贺忍者村”的日子并不好过，因为他长得瘦小，面容清秀，常被耻笑像女人一样。所以经常被同学排挤，而且变成了大家的取笑对象。后来渐渐地大家不知为何都开始疏远零，再加上他性格冷漠孤僻，逐渐被孤立了起来。
“伊贺忍者村”有十班每班二十人，最后每班只能有五位学生毕业，其余的要么失去成为匿名者的资格，要么送去加入后勤军团。零就被安排在第三班，这一班有很多成绩优秀的学员，大家都认为三班是最有可能进入刺杀兵团的。因为刺杀兵团招收人最少，所以可以进入刺杀兵团的人都是精英中的精英。
“你们谁亦不要偷懒，如果被我看到可是会追加受罚的！”一位长相凶恶，体型壮实的教官正在训导学生，他就是三班的教官熊本先生。
熊本先生穿着一身黑色的教官制服，他头上带着