俘获了九鬼嘉隆以后，就第一时间任命他为水师校尉，负责自这些俘虏的倭寇士兵中挑选5000精擅水站的精锐，组建水师南营，战舰则主要来自俞家镇内所生产的30多艘福船战舰和一部走舸组成。
而原俞大猷所统领的水师营则改名为水师北营。
两营水师分驻扬武军治下南北两个方位，俞大猷的水师北营以北面中坝县为大本营，主力部队常驻中坝岛，维持麒麟县西北面的江道航线。
九鬼嘉隆的水师南营则主要驻扎在大溪口镇外的港口，维持麒麟县东南面的江道航线。
相信拥有大量合适水军兵源的九鬼嘉隆能够迅速将水师南营建立起来，而一旦拥有了这两大水师大营后，整个扬武军治下的水军力量将远超周遭各大势力，来往扬武军治下的各大水上商队也将得到保护，有利于维持和扩张司马宇治下的商业发展。
同时，司马宇还任命本多忠胜为忠武营校尉，同样负责挑选5000名精锐武士组建忠武营，而余下的10名倭寇武将也各自在忠武营内任职。
虽然这两营皆是由倭寇组成，但对于这两支自己所能信任的军队，司马宇自然不会吝啬，第一时间就自麒麟城调集了大量装备运来，用以装备水师南营和忠武营。