产工程部、功法训练部，保卫部以及不一样多加了一个作战部，根据职能的不同，还成立了丹药部、矿业部、灵植部、兽事部、阵法部、医药部、装备部、后勤部，以及效仿地球军方的训练部。并在此基础上，预备了各战区的配置。
各部的人事分布和职能，一应俱全，很多人不懂，则由新从地球来的几十个工程部的骨干进行讲解。
八百余道丹道基修士各有其职，职务均由晶机进行的分配，施以各得其所，各张其能。
当然，这其中有一半人马被安排进入关胜和马万全领导的各军团。预计每个军团为一万人的编制，现在却要少的可怜。初设五个军团，另三名军团长分解是杨再兴等在此战中表现上佳的战力超强的人员。
军团以下设一千人一队的团，团以三百人一营，每营又分三连，百人一连，是谷神宗军团的基本作战单位，原则上不和任何人单打独斗，击一人上一班，击十人上一排，击二十人就是一连，击百人则至少为一营，至少在对敌上一定要保持三人以上的对峙，而每连要有一名道丹初期修为，每营有十名，每团则在百名，一旦出现高强的目标，则由道丹完成组队，团灭之。
丹药部负责炼丹，医药部负责救死救伤，后勤部管理一切