回到山东之后的赵冠侯，手头第一件大事，便是整军。赵冠侯的根基，就是手上的第五镇，他这个巡抚印随时可以交接，只要第五镇在手，就不愁没有官做。反过来没了第五镇，官再大也是空架子。
山东目前的部队除了正军以外，旗城里有旗兵，地方有绿营防营，再加上之前的护路军，林林总总，兵力超过三万以上。况且山东民风尚武，加上由于山东经济发展，各地百姓难民，纷纷逃荒来此找出路。这些人中的青壮，如果不安排到军队里，也可能变成盗贼，破坏地方治安。
可是按袁慰亭给的一镇又一协编制，肯定是安排不开，有一批部队要被裁汰。对于这些兵，赵冠侯并不想放掉，解决的办法，就只能巧立名目。
首先是第五镇，表面上是按照袁慰亭给予的编制设立，但是实际操作中，孙美瑶的骑兵标，是作为架子标来培养。对里面的军官实行培训，日常训练中，也以棚头当排长，排长做哨官训练，这样一到战时，可以迅速扩充为骑兵协。而且单独设立一个镇属警卫营，由过去的米尼步枪哨扩编而来，所有士兵一律装备米尼步枪，军官则额外多两柄左轮手枪以及军刀。
其次就是扩大预备役的编制，大批士兵编入预备役、警查又在部队里额外