八年的时间，很多的东西都会被遗忘，很多的人也会渐渐在别人的记忆之中消失，在这八年的时间里面，昔日神奥地区不可一世的索罗组织被银河团取代，银河团一跃成为了取代索罗组织最强大的组织，而猎人协会也是继续和取代了索罗组织的银河团合作，两者可以说是在神奥地区平分天下！
而除了神奥地区，关东地区有邪恶组织的老大火箭队一枝独秀，而且成都地区也已经是被火箭队渗透的差不多了，虽然说还是在暗处，但是却也已经很明目张胆了，现在火箭队的手已经是触及到了丰缘地区，昔日丰缘地区也是有着火岩队和水舰队两个邪恶组织的，但是可惜，这两个组织为了召唤出固拉多和盖欧卡花费了不小的代价，之后又没有办法控制这两只神奇宝贝，平息了这一次的风波之后，火岩队的老大赤焰松以及水舰队的老大水桐悟也是发现人类的力量实在是太过渺小，决心痛改前非，纷纷解散了组织！
而合众地区的等离子团也是在最近几年之中涌现出来的青年才俊小智和他的伙伴的努力之下宣告破灭，银河团和猎人协会的人也是开始将手触及到了合众地区，一时之间，鱼龙混杂，暗流涌动，虽然说表面上看起来依然是一副风平浪静的样子，但是各方势力已经是开始渐渐有了想