心急如焚，连忙上疏，‘混一区宇，统一台湾’是他的素志，‘即便肝脑涂地，也是臣之愿也’。
皇帝十分头疼，连着宣大臣入大内商议，谁知诸臣工也是纷争不断，以索额图和明珠为分成两派，一派支持施琅，一派拥推姚启圣，让皇帝难免对自己之前允诺施琅便宜行事的话稍微泛起嘀咕。
最终只谕令总督姚启圣统辖全省兵马，同提督施琅一道进取澎湖台湾，至于其余人如巡抚等，不必掺和了。
这两全之计显然并不十分效验，但施琅暂时先顾着练兵造船，姚启圣要招安禁海，矛盾得以暂缓。
容悦见皇帝政务繁忙，胃口不开，每日都细心炖了烂烂的米粥或着羹汤亲自送去乾清宫，皇帝有时陪她说几句话，有时连一面都见不成，只是新上任的翰林院学士陈廷敬、高士奇等在上书房供奉的时候多，每回皇帝有好东西吃，都会分赐给在侍奉的官员，因此沾了不少口福，容悦知道后暗暗留意，每次都多准备出两三份出来。
十一月里又抓住了吴三桂的心腹重臣辅佐吴世藩继位的夏国相，凌迟处死，紧接着就是一系列善后，抚恤，封赏的事宜。
丁酉日，皇帝以滇逆荡平，遣官祭告天地、太庙、社稷。并在灾祸连绵的广西等地补