得到了阿苏家的效忠之后，黑田家还没有完全掌握肥后国，因为还有作为原来肥后国国主的菊池家的三大佬的存在，他们分别是赤星家、隈部家和城家。
这三家之前在别人打生打死的时候，作壁上观，现在黑田家打上门来了，他们终于是想起来了自己原来也是会被打的。他们最后还是决定要维护自己武家名门的尊严，最后肥后国大名赤星统家、隈部親泰、城清冬三人一一被黑田家击败，在自己的居城战死或者是切腹。
再之后竹中重治向北挺近，天草郡的之前击败过岛津家的天草五人众，在商议之后，知道大友家大势已去，需要更换一个更强大的主家，于是全部主动向黑田家降服，至此丰后国和肥后国全部落入了黑田家之手，黑田家距离一统九州，就只剩下了肥前国和筑后国，还有丰前国隶属于城井镇房的领地了。
天正九年年（公元1579年）夏初，黑田家起一万大军进入肥前，肥前国大名筑紫广门审时度势之下，选择直接降服于黑田家麾下。再算上秋月种实和立花鉴载本来就已经是黑田家麾下了，肥前国也完全成为了黑田家的领地。
筑后国的国主之前是大友家麾下的蒲池镇久，他已经随着大友家死在了丰后国，目前主持蒲池家大局的乃是蒲池镇