了一番没有什么太多异议的讨论之后，众人都同意了后藤基次的办法，之后黑田家大军开始了对于水攻的准备工作。
这是一个比较大的工程，需要在两条河流的上游进行截流，不但黑田家的人马参与了工程，最后还通过钱粮的方式，对周围的百姓进行了谱请，才达到了预定的目标。
在经过了大概半个月的准备时间之后，由总大将母里隆友自己亲自动手，揭开了太田城上游河流的拦截大坝，河水犹如千军万马一般，对着太田城的方向奔流直下，并且快速的将太田城外围的各种阵地，和人马全部都给冲的七零八落。
而且经过了这一次的水攻之后，太田城内的粮食也受到了非常大的损失，在城中目前有六千守军的情况下，还加上各种城中的百姓，每天都有当时的粮食消耗，这是不能够避免的事情，更何况现在他们自己还全部都泡在水中间呢。
最后在围困了一个月之后，佐竹家终于受不了了，在黑田家的要求之下，佐竹义重带着家中的几个一门众出城，在黑田家大军面前切腹自尽，以换取城中所有居民的安全，这也得到了母里隆友的同意。
看到关东大名佐竹义重都要切腹自尽，上杉景胜和直江兼续非常的庆幸，他们庆幸自己没有继续反抗