很多思想先驱和著名的科学家都曾经是共济会成员，而共济会里的贵族成员可以为这些人提供保护，避免他们遭到天主教会的迫害。
希特勒非常敌视共济会，因为一个非纳粹控制的组织，必定会对他建立的国家新秩序造成破坏，比如说纳粹建立的各种商业、工业、农业自治会，其中掺杂着大量的共济会成员，纳粹党绝不会允许一个具有跨领域性质的团体，游离在他们的政治和经济体系之外。更别提这个组织非但不受到政府控制，同时还与海外保持着密切的联系，高层具有反纳粹倾向，内部成员中还存在着大量犹太人。
这样的一个组织，当然会被纳粹党视为反动和腐朽的，就算一部分成员不倒向纳粹，希特勒也不会容忍它继续在他的眼皮子底下存在。
德国共济会在几周内被纳粹政府撕成了碎片，在德国境内发生的事情，引起了英国和法国共济会的警觉，当他们想起要为德国分会的兄弟做些什么时，纳粹德国的坦克已经碾过了波兰边境。
德国共济会的迅速灭亡，留下了大量的政治和经济遗产，其中大部分有型资产被纳粹党羽所瓜分，但是那些无形的遗产依旧保留了下来，那就是共济会建立的商贸网络和市场，以及成员保存的各种经济、政治和文化档案