仿照天主教的模式在泉州开办了一所小学堂，主要教授一些有趣的自然知识和数学等科目，一切费用都是陈健自费。
然而一上船陈健离开就翻了脸，叫人将登船的人按照宗族、姓氏和居住地全都打散，塞入船中，扬帆向西前往台湾。
沿岛向北找到了淡水河，选了一处位置优越的地方，作为堡垒和炮台的建筑地，就叫人下船暂且停靠，离开伐木运石修建堡垒，又拿一些玻璃铁刀棉布之类和沿河一带的原住民搞好关系，买了偌大的一块土地。此时尚未站稳脚跟，语言不通，这些原住民暂时不要招惹，将来都是些劳动力。
一时间淡水河附近炮声隆隆伐木叮当，精通工程学的测绘水文高度，将炮台建在了淡水河北岸一处高地上。
那些到了这里的贫民暂且先做些搬运建筑的事，陈健许诺日后自有土地与他们，又可以贷款给他们购买耕牛铁器等等，人心倒也还算安稳。
清点本部的船只，选出了三百士兵和四条船，载着一些货物以及一些雇来的福建水手海员，叫这四条船前往琉球折向长崎，再从长崎前往江户，去拜会此时已经是征夷大将军的德川家康，请求贸易和在浦贺和平户两处建立贸易站。
给德川家康的信上也算是详细地