众人通过军队重新编制的决定之后，商毅也立刻下令，开始按自己制定的编制方式，对全军进行整编。首先确定了五个团的团指挥部，然后让各团指挥部讨论确定自己的下级军官，然后报到商毅这里来批准。
当然这里面也少不了扯皮拉筋的事情，因为不少人都会被各团部争来争去，毕竟打了这么多仗, 谁能打大家心里都基本有数了.比如在守卫穆陵关时从军的王虎，虽然从军的时间不算长, 但在数次战斗中，都表现得十分勇猛，因此虽然只被确定为是个排长，但有三个团部都争抢着要他, 一直闹到商毅那里去了。
最后商毅也没有办法，只能用抽笺的方式来决定王虎的归属，结果三团幸运的抽中了乐透笺，得到了王虎。后来商毅索性就全用抽笺的方法，确定各个团部挑人的先后顺序。
而就在这时，朝廷的旨意终于下到了登州，要曾化龙带商毅即刻进京朝见。曾化龙收到圣旨之后，也觉得十分奇怪，因为在圣旨中，并未说明对商毅有什么晋升嘉奖，也就是说现在商毅将以一个千总的身份，到北京去朝见皇帝。
原来曾化龙上传到北京的奏本，引起了整个大明朝廷的巨烈震荡，一个小小的千总，在十余万清军南下的袭掠中，虽然独守一座关