崧登基以成定局，那么就尽可能多的在朝廷中，由其是在内阁中安插人手，执掌朝政，也不失为是一个补救的办法。但马士英自然也不会放弃自己的权利，虽然他是拥立朱由崧继位的首席功臣，但如果不能入阁理事，那么一切就都成了浮云。
明朝的内阁制度首创于永乐年间，正式形成于宣德年间，一直到在正德年间，才逐渐成熟完善，因此尽管在后来明朝出现了两个二十多年不上朝理事的皇帝，但依然沒有大乱，内阁是起了相当大的作用。内阁的人选，一直没有定数，最多的时候有七人，最少只有一个，但在正徳之后的大多数时间里，一般都保持在四到五人之间，而围绕着新朝的内阁成员的人选，又展开了新一轮激烈的争吵。
而这一次出风头的，是上一次拥立朱由崧为帝时，被给事中李沾之抢了先的诚意伯刘孔昭。在史可法宣布推荐內阁戍员之后，刘孔昭首先出列，居然推荐自己入阁。这一下顿时上下大哗，史可法也被弄哭笑不得，只好道：“勋臣入阁办事，本朝尚无先例。”
刘孔昭马上接了一句：“即我不可，马瑶草（马士英字瑶草）有何不可？” 其实刘孔昭也知道，自己是肯定入不了內阁，自荐不过是个幌子，重点是推荐马士英入阁，这样一来，自己在马士