郑芝龙视为自己在海上潜在的最大对手。虽然这个时代还有西班牙、葡萄牙和荷兰等海上强国存在，但这些国家都离中国太远，后勤支援起来十分困难，缺乏持久力，而且他们都需要和中国的贸易，因此也都不会希望与中国的某一势力长期树敌。
不过现在的情况不同，商家军的海军己经初步成型，而且在龟山岛一战中，也得到了实战的检验，虽然还存在着许多不足之处，但实力也绝不容小视，因此就是和郑芝龙正面相抗也不怕，更何况商家军还有一支强大的陆军存在。这正好是郑芝龙的弱点。而且郑芝龙的势力主要在广东和福建，正好是和浙江相邻，如果在海上真的打不过他，那么就从陆上打过去，让郑芝龙在陆地上无法立足。
当然这只是做的最坏打算，商毅并不想和郑芝龙为敌，能够以和平的方式解决两人的矛盾或是争端，当然是最好也不过了。毕竟在这个时候与郑芝龙恶交，只会是个两败俱伤的结果，另一方面，不管怎么说，郑芝龙还是生了个好儿子郑成功，商毅也不希望与这位另一时空里的这位民族英雄为敌，因此那怕是能够让出一部份利益，能够换来与郑芝龙达成共同拥有海外贸易的某些协议，也是值得的。
不过这些都是商毅的想法，能否如愿，还要看郑