等战场都清理得差不多的时候，商毅又接了另一个消息，在战场上逃走的三艘西班牙战舰，还有后面西班牙军的六艘运需船，在返航的路上，遭到了迂回到西班牙军后方的商家军海军第二分舰队的攻击，被击沉四艘，俘虏二艘，最终只有三艘船逃走。也为这一场海战，划上了一个完整的句号。
而这三艘逃走的船在台湾东南沿海时，又遭到荷兰船队的拦截，最后只剩下一艘船逃回到马尼拉，向菲律宾总督科奎拉报告。
这时太阳终于完全消失在西方的天际，黑夜降临在大海上。商毅也下令，全体战船返航，回到基隆港去休息。
这一战商家军一共出动了七十一艘战船，在主要战场投入四十七艘，其中主力战舰二十五艘，共计士兵三千二百多人。西班牙军出动了二十四艘战船，在主要战场投入十八艘，士兵一千五百余人。
结果是商家军取得了全面胜利，击沉击毁对手十四艘战船，俘虏七艘，其中包括西班牙军的旗舰圣路易号，打死西班牙士兵一千二百余人，活捉六百余人。并且缴获各类火炮三百余门，火枪一千余枝，其中有三百多枝是燧发枪，战马三十四匹，其他粮食物资若干。
而商家军自身，被西班牙军击沉战船八艘，包括六