严加守卫，以防李本深、胡茂祯等人有诈。
不过有史可法从中调停，又在商家军的兵势压迫下，李本深、胡茂祯等人到也不敢乱来，只用了两天时间，他们就和商毅办理好了各顶交接手续，然后带领着人马，连同邢氏、高杰的幼子一起，离开了淮安，到高邮去驻扎。而史可法仍然不放心，跟着他们一起回到高邮，一直到把高杰的余部都安顿好了之后，史可法这才返回到扬州。
而这时在凤阳那边，刘良佐和黄得功见这次史可法把商家军请过江来了，到也有了一点信心，他们对啇家军的战斗力还是有体会的,因此两人也各自带领着人马，分别进驻凤阳和泗州，守住了扬州西面，这也让史可法放心了不少。而这时商家军第三师的人马也渡过了长江，来到了扬州，史可法赶忙又给他们安排驻扎的位置，同时也准备仓库，存放物资。