利好的方面有许多，首先是可以继续保留一个与日本稳定的通商渠道；并且可以通过他们，取得日本方面的情报、消息；另外这次进攻萨摩藩，虽然不准备深入腹地，但如果有个熟悉当地情况，又可以信任的向导，还是可以提供很大的便利的。必要的时侯，还可以充当中间人。
而从长远来说，未来他们有可能会提出借助自己的力量复国，但反过来说，自己同样也能以为丰臣氏报仇的名议，攻伐曰本。反正决定权在自己手里。只要自己有足够的实力，这一步也是早晚要走，这不仅仅是因为商毅对日本人的痛恨，而且从地缘政治学上来说，在中国的周围，最好不要有一个能够与中国竞争的国家。虽然这是很遥远的事情，但并不妨碍商毅早早的先挖好坑，散几个种子。永远都不要等到等到想吃果子的时候，才开始想着要去种树，这个道理商毅还是懂的。
当然不利的方面也不是没有，那就是现在就会给自己树立一个敌人，德川家光是决不会允许丰臣氏的余孤在中国进行政治避难的。虽然说这时的日本武力松驰，而且也根本没有像样的海军，但毕竟是一个国家，调动几十万大军也不是不可能，因此这样一个敌人，也不可轻视，何况目前自己的首要大敌还是清廷，没必要另外树敌。