虽然十八师的师长李成栋返回到大同镇之后，也在开始准备撤离大同镇，但并不等于是把部队一下子全都撤走，而是釆用层层后退，逐步撤离的方式，首先让九师的炮兵团先行撤退，而其他部队则放弃了镇外的阵地，退回到镇子防守。
而清军看到商家军退却，不觉都信心大増，因此进攻也更为凶猛，有好几次都己经突入到大同镇里，但商家军的防守强度也猛然加强了不少，甚致在局部阵地上，还向清军发动反击，有些阵地，双方都要反复争夺好几次，清军想到前进一步都十分困难。而且清军是进军的一方，遭受的损失也比商家军要大得多。
大同镇的战斗一直进行了十月一日，商家军才完全退出，清军终于全面占领了大同镇。
尽管为了攻取大同镇，清军付出了阵亡一万余人的代价，但洪承畴和勒克德浑依然十分满意。到这时，清军对湖北商家军的第四次征剿己经进行了一个多月，清军一共收复了八个县，湖北地区的大部份地区都己经收复了，商家军现在占领的地区只剩下黄安、麻城、罗田三个县，这是前三次征剿都不曾有过的胜利，清军对湖北商家军的征剿也取得了阶段性的成功。
但清军这时己经损失了二万五千左右的兵力，同时修筑的堡垒也