清廷在南阳地区防御的主将是怀顺王耿仲明，驻守兵力约有八万五千左右，其中也还包括一支新军神兵营，兵力约有一万三千余人，神兵营的统领是李永芳的五子巴颜，也就是驻守山东兖州的李率泰的弟弟。
虽然和徐州、山东相比，南阳的驻军显得少了一些，但清军在南阳西北的陕西西安府，还有尼甚和韩岱的驻军约四万五千人，另然在湖广以西，就是吴三桂的四川，不管什么说，现在吴三桂也是偏向清廷一边的，因此南阳地区有诸多的后援，防御实力并不算差。
但让耿仲明觉得十分苦恼的是，清廷所封的四大异姓王中，孔有徳已死，尚可喜在广东奉立朱以海为帝，成为南明永安朝廷的实际掌权者，在名议上已经叛清，而吴三桂也在四川形同割据，当上了土皇帝，都属于是在我的地盘我做主的那一类，只有耿仲明现在仍然不得不受制于清廷，沒有自己的立足之地。
虽然现在耿仲明奉清廷之命，在南阳驻守，尽管在名议上，南阳的所有守军都归耿仲明节制，但其中真正属于耿仲明嫡系的部队，只有四万余人，而在其他有部队除了神兵营之外，还有汉军正白旗固山额真石延柱部约一万八千人马，神兵营其实是听命于石延柱的。其实耿仲明根本就调动不了他们。