有船只为军事管理，这也是最为常见的方法，然统一进行指挥。这种方法的优势是可以掌握大量船只，缺点也是极为明显的。陈诚等军人毕竟不如船运公司精通运输工作。很容易出现所谓外行领导内行的情况，导致就算有船但是无法使用。
第二便是放军事统一管理，由几家民间公司来负责，军方给予控制和指导工作，因为他们是最了解长江航运的，是第一线真正的行家。
陈诚思前想后，决定冒险走第二条路，这也是当年的南京给他的教，船运一事还是要行家来做。陈诚便力邀卢作孚来做这次撤退的带头人，更是向蒋中介为他要了个交通部次长的位置以便他指挥。
“陈长官，唯一的办法就是分段运输，要想直接把物资一下运到重庆是不可能了。”卢作孚顶着全是红色血丝的眼睛说道。
“哦？你说说怎么个分段运输法？”陈诚立刻问道。
“分为三段，你也知道，我们长江的吃水度不一样，最要命的就是那三峡，哪年不吞个几百人的命，而且很多船根本过不了三峡，我看这样，我们先河陆齐用，把所有的人员和物资运到宜昌，宜昌距离武汉水路不过五百公里，而且这一段的水路较为好走，又有岳阳接应，安全也有保障，即使武汉失守，