受佛法感化，渐渐通了开了心智。甚至每当寺中早晚课，池中那些已经能晓人言，能明人事的通灵之辈，也浮出水面，头朝观世音大士，吐着水泡，也跟着虔心诵经，期盼着有朝一日，能够修习佛法，化身成人，得证大道。
不久，南宋覆灭，元朝建立。部分南宋臣子，逃到普陀岛上，为了躲避追杀，在空地修了几处庙宇庵堂，藏身于佛门。小小普陀岛，本来就那么大，日子久了，大家难免会起争执。有一日，宝陀观音寺中僧人，不堪被这些外来人联合起来挤兑，便偷偷渡海，跑到岸上，向官府告了密。
过了半月，便有一队水军，五六艘军船，将普陀岛所有码头堵住，兵分几路，冲上山岛，见庙便烧，见人便杀。到了后来，那些军士杀红了眼，竟连那原本得到元朝认可的宝陀观音寺、紫竹林、不肯去观音院等处，也一概遭到血腥清洗。
药善还记得那一日，宝陀观音寺的僧众，听得寺外杀声震天，火光四起，个个面无人色，在主持的带领下，跪在大雄宝殿，齐诵佛经，却被随后撞开大门，如狼似虎地军士，提着血淋林的刀剑，一一砍杀。那领队之人，又吩咐下属，在大殿四处点火，及走到后面，看到观世音菩萨脚踏鳌鱼，不由怒道，“他奶奶的，一个泥人儿，还脚踏鳌