部职方司郎中，然后被魏忠贤嫉恨而罢免。
崇祯元年在陈于廷的帮助下被重新启用，官复原职。
不到三个月，就升为兵部右侍郎，镇守昌平，密云等地，而昌平又是大明皇陵的所在地，而且还收下了一个大明历史上举足轻重的人物左良玉。
左良玉原本是山东临清人，后投身军伍，天启七年随军调入宁远，因功晋升为都司。
第二年因粮饷问题，宁远兵变爆发，宁远十三营的蜀、楚士卒，以张正朝、张思顺为首，歃血为盟，欲讨回欠发的四个月薪饷，他们攻入幕府，抓到前户部尚书毕自严的弟弟，关宁巡抚毕自肃。
而左良玉身为客军将领，当时麾下也同样缺吃少穿，便大着胆子抢掠了一把，好让底下的士兵不至于闹事，到手之后才发现是运往锦州的饷银，然后就被追责，本来是要砍头的，但是让他的好友邱磊扛了下来，左良玉也就夺去军职。
后来回山东的时候遇到侯恂，被侯恂看中，不计较他的罪责，就收入帐下，同样给予他都司的待遇。
至于为啥侯恂愿意帮助左良玉，是侯恂慧眼识珠，觉得左良玉能打仗么？其实并不是，主要是左良玉长得好。
明朝中叶以后，龙阳之风甚炽，军