便开始烧杀抢掠，四处抄家，北京城变的乌烟瘴气。
同年四月，因为山海关总兵吴三桂降了满清国主豪格，豪格亲率清军入关，长驱直入，直奔北京城。
四月底，李自成被逼退出北京城，临行前怒杀吴三桂一家老小三十四口人。
豪格占了北京城，命手下大将继续追击李闯。
而同年五月，消失几个月的崇祯皇帝在南京竖起大明朝的大旗，建立南明朝廷，誓师北伐。
天下从此战乱不休，清军在太原与李闯大军一战，中了伏兵，伤亡惨重。
清帝豪格大怒，亲率大军追击李闯余部，李闯大军因占据北京城之后的所作所为，民心已失，李自成也越来越易怒，部下纷纷离心离德。
最终，李闯大军在陕西境内，被清军所剿灭，李自成则是不知所踪。
清军一股作气，剿灭了四川的张献忠。
而清军也因为在西征李闯和张献忠之时，伤了元气，无力南下，清帝豪格只得暂缓一统天下的大计。
因崇祯皇帝尚在，且经过一场巨变之后，崇祯皇帝变化良多，朝野上下有目共睹，明军虽然誓师北伐，但大军却是据江而守，伺机以待。
南明朝廷因为崇祯皇