一阵敲门声把小智从愣神状态拉了回来，小智急忙对梦幻说道：“梦幻快躲起来。”梦幻闻言立刻飞向了天花板，见梦幻藏好，小智才打开了门。
只见门口站着一个研究员摸样的人对着小智说道：“小智，大木博士叫你去大木研究所一趟。”
小智闻言回答道：“好，我知道了。”然后小智又回头对这皮丘招了招手，皮丘会意跑到了小智肩膀上，小智又对着房间内整理衣物的花子道：“妈，我去一趟大木研究所，一会儿回来。”
花子回答道：“知道了，小智，快去吧。”
于是小智带着皮丘跟着研究员朝大木研究所走去。
就在小智刚踏入大木研究所外面围墙的大门，突然研究所发出了剧烈的爆炸声，小智急忙带着皮丘和一脸惊慌的研究员向着研究所加速跑去，等进入研究所之后发现大木博士正指挥着一只强壮的尼多王和一只强壮的尼多后和一众火箭队的小精灵激战。
原来由于梦幻在真新镇里使出了几次瞬间移动和一次泡泡防御的手段，导致火箭队的一组搜查队员检测到了梦幻的波导在真新镇，立功心切的火箭队在匆匆侦查了真新镇以后认为梦幻最有可能藏在大木研究所里，毕竟大木博士是世界闻名的人物，