时光飞逝，白驹过隙，两年的时间很快就过去了，如果不是玄冥身份所带来的天赋加成，玄冥是绝无可能完成支线任务一的，即便有着天赋的加成，玄冥也差一点失败，两年的时间学完机械学和工程学让玄冥正正体会到学习的困难之处和拼命学习的压力。好在接收到seed能力后，玄冥算是真正和原本的几位超级调整者有了相同的qi点，不过玄冥相信，只要自己能完成各种系统发布的任务，自己肯定能超过他们。
在这两年的时间里，理事会也不曾放弃阻止PLANT独立，C.E.63年PLANT的能源生产部门被蓝色波斯菊的恐怖活动破坏。事后，PLANT评议会向理事会提出暂时停止能源输出的申请，但遭到否决。PLANT遂陷入严重的能源危机之中。出于对理事会决议的反对，PLANT的技术人员同时罢工。对此，理事国动用MobileArmor舰队向PLANT进行威胁。PLANT内独立呼声高涨。在这样的背景下，以克莱恩、帕特利克两位评议会议员为首的独立组织成立，并开始在暗中活动，同时为了自保，PLANT的MobileSuit军用转向研究开始。在玄冥和阿斯兰到校报到的第一天，两人就认识了基拉大和，玄冥只是和他相互认识，阿斯兰则和