随着战争进程不断推进，木叶支援终于到来。
旗木朔茂如同原著一般，在一次任务中，为了拯救同伴而放弃了原定的战略任务。
原本他们已经接到木叶的指派，前往沙忍村制造混乱，好使得沙忍从前线调拨一批精英回防忍村。以减轻前线压力。
可是，沙忍再得知后，发现木叶并未对沙忍村造成什么大的影响，同时，仇恨滋生，对木叶发起猛烈攻击。
最后导致木叶前线损失惨重。
旗木朔茂难辞其咎，被调回村子接受审查。
但是猿飞日斩看在战争时期，村子继续高端战力维护村子利益，便让旗木朔茂暂时闭门思过。计划着，若是水之国宣战了的话，就派他去往水之国战场。
在将功赎罪的想法下，或许旗木朔茂能给出更加让自己满意的答卷。
然而，猿飞日斩的好心却让团藏产生了误会。
自始至终都将人生目标定在火影位置上的志村团藏，在得知猿飞日斩的做法后，误以为猿飞日斩是想将旗木朔茂作为接班人培养。
同时，旗木朔茂的行为严重违反了团藏内心对忍者的定义。
即是惩罚，又是防备。
团藏让根