此时此刻的主世界。
奥创已经通过信使将秘密入侵的事情通报给了无限森林和高阶天堂，可是却并没有得到双方的重视，神圣天女兽和莫斯提兽均认为这又是奥创的什么伎俩，纷纷无视了这个情报。直到之后的某一天里发生了那件事，彻底震惊了两大天使与莫斯提兽他们，与此同时也终于是彻底拉开了秘密入侵的序幕。
那是一个十分平常的早上，神圣天女兽与莫斯提兽在进行了例行的联络之后，决定各自派遣一只小分队去两个国家的边境碰头，由于无限森林在之前的事件中受到了十分严重的损害，因此高阶天堂决定为无限森林的国民们提供补给，帮助他们度过难关，这次的碰头就是为了确定补给的清单。
然而……这两只小分队却遭遇到了神秘势力的团灭。
当然，若仅仅是如此还不足以使双方的高层们震惊，这只小分队的成员们都是些成熟期的数码兽，哪怕是两三只完全体都足以团灭他们了，数码世界高手如云，其中不乏那些脱离社会关系而存在的独行侠，因为惹到了他们而被团灭的事件也不止一次两次了。
真正令他们震惊乃至恐慌的是后面发生的事情……
莫斯提兽派了搜索队前去搜查，却从这两只队伍