李元吉在刺杀自己时候已经被自己奋力反击击毙。
唐高祖李渊听说太子和齐王已经死了，不由眼前一黑，昏了过去。好半天被太医救醒后，黯然泪下，“怎么会这样呢？怎么会兄弟相残呢？现在该怎么办啊！”
李渊的大臣萧瑀和陈叔达说：“太子李建成与齐王李元吉本来就没有参与举义兵反抗隋朝的谋略，又没有为天下立下功劳。他们嫉妒秦王功劳大，威望高，便一起策划奸邪的阴谋。现在，秦王已经声讨并诛杀了他们，秦王功盖宇宙，天下归心，陛下如果能够决定立他为太子，将国家大事委托于他，就不会再生事端了。”
唐高祖李渊沉默了一会说：“秦王功勋磊磊，众望所归，当太子是最好的人选。”
李渊又心怀愧疚地对李世民抚慰道：“近些日子以来，我听信谗言，委屈了你，冤枉了你，请不要放在心里，大唐江山社稷还需要你来支撑啊！我把大唐江山交给你也是最放心的。”
李世民跪了下来，伏在父皇的胸前，号啕大哭良久。
事后，李世民宣布，叛逆的罪名只加给李建成和李元吉二人，对其余的党羽，一概不加追究。
当天，高祖颁布诏书大赦天下。唐高祖李渊下诏书立秦王李世民为皇太