果纯度不高，就会影响大田的亩产量。本来可以打亩产千斤稻谷的，若是纯度不高，少则亩产降低三五十斤，多则减产一两百斤也不乏其事。纯度的控制，一是亲本的纯度要高，也就是父本和母本的种子里，绝对不能有杂种，否则，将贻害无穷。
比如说母本吧。如果供制种用的母本珍汕九七不育系中有棵杂种稻，它结出来的种子后代，成为大田的种子以后，虽然也可以抽穗扬花，却是不能结实的空稻壳，颗粒无收。
要是父本呢，结果会更严重。若是供制种的父本种子里混入了一株普通水稻种子，普通水稻的花粉没有恢复不育系秧苗结实的能力，若是花粉传授给不育系，虽能结出种子，但这粒种籽播种长出的秧苗，就没有抽穗结实的能力，永远处于只分蘖不能拔节扬花的状况，结果呢，正常的杂交稻秆青籽黄可以收割了，而它仍然像不能生育的“石女”孤伶伶地站在田里，人们形象地称之为“大青棵”。
一块稻田里，那怕只有三两棵“大青棵”，虽说对总产量没有什么影响，但看上去十分抢眼，像是鹤立鸡群一般。要是有个十棵八棵或是几十棵，那么，这块田里就不像样子了，说明种子的纯度有严重问题。到了第二年，销售这些种子的单位就无法再出售新种子了。这