自然中发生事物的管理神。最著名的，莫过于雷神，雨神，太阳神之流。但更加确切来说，自然神分为三类。
一类是天体，包括天神、日神、月神、星神。人类剧增之时，天神地位与日俱增，成为诸神之首，认为天界为诸神所居，天帝为大。
二类是自然现象，包括风神、雨神、雷神、电神、火神。
三类是无生物，包括山神、土地神、水神、石神、海神、潮神，其中土地神又称社神，《孝经援神契》载：“社乃土地之主，封土以为社。
自然神的神系，乃是世界成型之后便出现的神明的，虽然不能称为强大，但是也能在神明之中排上名号。而无论是哪一位自然神，都是拥有一部分的天地之威，除非它掌管的现象实在是弱智到不行。所以只要是自然神神系的神明，可以说都是强者，在你们没有成为真神之前，无论如何请不要触碰。
”
“接下来就是第三神系，天生神。
举一个例子，在希腊神话之中被称为原始神只（支）的神明便是天生神。也就是混沌之神卡俄斯；?大地女神该亚；天空之神克洛诺斯等等。要想理解也很简单，众人通常所知道的希腊神明--宙斯，其实是天空之神克洛诺斯和大地女神该亚的孙子。