看着小智出现在研究所的门前，大木博士还是略微有点吃惊的，本来在计划之中的确是预留了四只初始精灵给四位从真新镇出发的四位新人训练师。
但是，那只皮卡丘真的是一个问题颇大的儿童，大木博士本来想着今天既然只来了三位，那明天就再申请一只初始小精灵给最后来的那位新人训练家就好。只是令他没有想到的是，居然4个训练家都是今天到达研究所的。
无奈的大木博士又没办法告诉小智自己的想法，所以只好把他和石原初一起带进了研究所的大门。
随着大木博士来到了他平时放置初始精灵的桌前，上面放着三颗分别贴着火、水、树叶的精灵球，大木博士闭着眼睛说道：“凡是到我研究所的新人训练家都有资格获取一只关都地区特有的初始小精灵……”
然而还没等大木博士说完，小智就抢先说道：“大木博士我知道，为这一天我已经考虑很久了，今天之所以迟到也是因为在考虑选取哪一只当做自己的初始小精灵，但是现在我已经决定好了……”说完小智就从桌子上拿起那颗代表着水系小精灵标志的精灵球，按动了上面的按钮非常中二的喊道：“杰尼龟，就决定是你了！”
然而随着小智把精灵球打开，里面确是