黄石将军，进行全方位的百般打压（因为黄石曾经得到天启先帝的重用，跟九千岁魏忠贤也比较亲近）——虽然在朝堂之上，有帝师孙承宗等人极力抗辩，声称当前国家战乱不断，绝不可无故而斩大将，所以没有让黄石落到了跟魏忠贤一样的下场，但在东林党全面反攻倒算的浪潮之中，福建官府也不甘落后，不仅完全停发福宁军的饷银和口粮，甚至纵容缙绅侵吞福宁卫的耕地，企图一步步将这支“阉党爪牙”摧垮。
孰料曾经屡破建奴的福宁军，并非内地卫所那种可以让文官随意揉捏的软柿子，而是一支无法无天的骄兵悍将。面对巡抚衙门的公然迫害，福宁军迅速展开了最激烈的武力对抗——官府的衙役、缙绅的家丁和熊文灿的“抚标”（巡抚直属卫队），都被黄石轻而易举地打得大败。亲自带队去霞浦找黄石麻烦的熊文灿，甚至因为有内鬼告密的缘故，居然很倒霉地成了俘虏，最后被迫签下了一大堆文书才给放了回去。
——熊文灿固然可以上奏朝廷说黄石谋反，但问题是福宁军就驻扎在霞浦，内部又是水泼不进，个个都对福建官府恨得咬牙切齿，随时可以攻破福州，来个先下手为强。更别提黄石还是曾经孤身入辽阳格杀努尔哈赤的“天下第一高手”，熊文灿实在不敢赌自己的脑袋比努尔