这两大圣地的佛寺，不仅历史悠久，而且往往跟皇室有着千丝万缕的关系，自古就有许多皇子和天皇在那里出家，早在平安时代就对日本政坛有着巨大的干涉能力。
由于具备着如此庞大而深厚的在朝与在野势力，即便是掌握国家机器的历代日本当权者，一般也都对佛教界奈何不得。幸好日本的佛教内部宗派众多，各有各的教义和纲领，彼此分歧对立得非常厉害，寺院之间通常也没有明确的隶属关系，一直难以形成合力，这才未能抢班夺权，把日本变成一个“地上佛国”。
——战国时代的本愿寺一向宗曾经如此努力过，并且一度对武家社会构成过挑战，但最终还是失败了。
总之，日本的佛教徒们虽然一盘散沙，无法对国家政权构成强力的挑战，但若是有谁胆敢与整个佛教界为敌，那么由此导致的结果简直堪称噩梦，跟在中世纪欧洲反对基督教的难度也差不了太多。
在日本古代历史上多次降临的乱世之中，地方军阀若是被朝廷定为“朝敌”，倒还没什么大不了的，只要打个胜仗就能摇身一变成为忠臣。但要是不幸被扣上了一顶“佛敌”的帽子，那么就会如附骨之蛆一般，被一波接一波的佛教徒起义折腾得焦头烂额。比如那位鼎鼎大名的“第六天魔王”织田信长