博物馆里最后面的两个院子里，一个院子开放，另一个院子则是游客止步，可能是作为仓库使用。
在这个开放的院子里，全是博物馆的镇馆之宝，有在东平县发现的汉墓壁画，是鲁省迄今发现年代最早、保存最完整、艺术水平最高的壁画，填补了本省汉代考古的空白，也是中国早期绘画作品中的精品之作，在全国极为罕见。
也有大汶口文化的红陶兽形壶，还有带152字铭文的西周晚期的青铜器的精品颂簋，龙山文化的蛋壳黑陶杯等等。
这些物品每一样都可以说是宝物，都是单独存放，有带红外线，加防弹玻璃的特殊箱子存放，箱子的钥匙都有专人保管。几个负责人，每人负责一个箱子的钥匙，一对一负责，责任到人。
但是就是这样也还是挡不住这个场馆大盗的脚步，博物馆的馆藏精品文物丢失了六七件，还有国宝级文物丢失了三件，“孙子兵法”竹简，鲁国玉璧，郑板桥双松图轴，这几样都是堪称国宝级的文物，当然电视上也只是公布了这几样国宝级的文物的名字和图片，让市民多提供线索。
场馆大盗之嚣张，让所有人都为之感叹，感叹博物馆管理之松懈，感叹警察之无能。
其实博物馆方面也有些有苦不能言，省博物馆建