所，太平天国的时候遭到相当大的打击（太平天国本就是个修行者创立的政权，其覆灭也是因为他们违反了术数界的规矩，修行者可以辅佐帝王，却不能与之争天下），到了清末的时候，茅山仅存三宫五观。
后日军发动战争，将茅山上的房屋摧毁了超过九成，那堪称浩劫的十年之中，茅山再度遭到严重打击，就连三宫五观也只剩残垣断壁。
当然，这损失的只是那些非核心的东西，道观丹井，都是可以修复的，真正的修行者，是并未遭受严重的打击的。只是在那些年代之中，多数的修行者都选择了闭关不出，并不去与俗世凡人争什么长短。
之后政府帮助重建了九霄万福宫和元符万宁宫，二宫和称之为茅山道院。
这当然并非茅山全部，真正的茅山派，多数人都居住在九霄万福宫之后的玉晨观中。玉晨观，才是茅山派真正的根基所在。
多数人是不会发现玉晨观的存在的，他们只是知道先秦时期有人名曰郭四朝在玉晨观中修炼，但是那个玉晨观，早就不复存在了，如今的旧址被称之为玉晨村。而真正的玉晨观，现在坐落在又被称之为顶宫的九霄万福宫之后，而且，和太一观有异曲同工之妙，在九霄万福宫后有一片树林，那片树林，除非是深谙道法的