王重阳晚年创出九阳神功。(看请牢记)但这神功威力太大，对修炼者资质要求极高。他座下七名弟子，也就是第一代的全真七子，都无缘修练。王重阳因材施教，把九阴真经分别传授给全真七子。反而九阳神功只能收藏在藏经阁中。等待资质上佳的弟子来扬光大。
成吉思汗当上大汗之后，感念当年王重阳对自己的恩情，封全真教为国教。但是辗转几代之后，全真教势力展过盛，却又引起了后任蒙古大汗的严重不满，甚至是忌惮。
全真教得到了蒙古人的扶持，几十年之间，势力迅扩张。终于在第四代大汗蒙哥的时候，蒙哥下令，让佛道相互辩论。佛门由密宗八思巴为代表，道门则由全真教掌教李志常，作为代表。
结果，全真教在辩论中，全面失败。蒙哥汗下令，焚毁除“道德经”之外的所有道教经典。并且勒令全真教大批道士还俗。道门因而遭遇了极沉重的打击。
九阳神功的秘笈，也在焚毁之列。但全真弟子不忍祖师心血被毁于一旦，于是拼死从火场中救出秘笈。
几经辗转，这名全真教弟子来到南方，把秘笈献给南宋朝廷。文天祥就此因此得到了九阳神功的心法，并且把心法收录在万象真藏之中，留待有缘。
百年之