发部门，这是一个综合部门，由智网世界、智慧生物、绿叶科技、宇宙科技探索公司等部门抽出精英组成，具体事由叶锦川负责，过去叶锦川负责的部门和子公司由他的手下副职接任。
科技研发部门的终极目标是开发出绝对领先的生物战舰，但是目前为止的任务是开发出以人工大脑为核心，智网世界联动的无人操作武器。
第二个是生物特种队部门，这个部门的将会用生物的方式对战士进行改造，建设一支由沈淮直接领导的生物特种战队。
第三个是对外部门，主要职能是对合作伙伴或者是合作国家培训生物特种部队，以及出售生物武器。
混沌军工成立以后，沈淮下达了两个命令，一个是不惜一切代价在最短的时间内开发出可以在实战中营运的武器；第二个便是以塞拉胡里族战士为基础，打造一批一个随时上战场的特种战士。
鉴于共和国国内的特殊的环境，国家绝对不会允许一个公司成立军工组织，更不会允许有作战能力的军队出现。
因此科技研发部门的实验场所将会放在漠北进行，而生物战士的训练场地将会有漠北和冈比亚两个地方。
沈淮将会在漠北以及冈比亚修建机场让两个地方能顺利的联通，而咏月岛混沌