，蓬勃发展的同时，造成许多严重的社会问题。大量的寺院积累了大量财富，逐渐形成与政府分庭抗议的新政治力量，出家人依仗寺院的权势胡作非为，不受平常法规约束。大量土地和税捐被宗教组织控制，严重侵蚀国力，在这种背景下，宇文邕决心禁佛。
经过灭佛运动，一方面迫使源自印度的原始佛教积极汉化，在中国儒教的思想基础上发展出中土的佛教，使原先以神怪力量和寺院财产和权利为基础的早期佛教转化为一种开放平和的教派，使得佛教在中国得到新生，发展转变成为世界上唯一一个不干预政治力的大宗教。
宇文邕的灭佛运动确立了沙门必须尊重皇权的政治的原则，断绝了佛教寺院与平民分权抗仪，确立了中国皇朝政教分离的传统。