进地下暗堡，由于暗堡内出水困难，堡内的军民坚持不住，只得走出暗堡投降了。成吉思汗让术赤派兵把城堡彻底的摧毁，又将几座清真寺也焚烧一空，大火一直烧了五天五夜，仍然浓烟不歇。
在最后投降的军民中间，按照成吉思汗的命令，把突厥人与康里人分开集合。因为突厥人与蒙古人为同一个种族，前者被赦免了死罪，而康里人全被处死了。
撒马耳干在这次战争中遭到了极大的破坏，全城被毁坏成一片废墟。在波斯语中，撒马耳意为肥沃，而干则是城的意思，所艾萨克马耳干便是一座肥沃的城。
在撒马耳干，到处是花团锦簇的公园，几乎每幢房子的前面，无论房子的大小，前面都有花园和院子，彷佛撒马耳干人全都是爱花爱草的人。城内水渠纵横，四通八达，为发展园艺提供了方便条件。每当茶余饭后，在座座公园里人群如织，大人牵着孩子，老人互相偎携着，一片宁静馨香的和平生活。
撒马耳干的能工巧匠，在整个东方都是很有名的。他们生产出交织银丝的织物，生产著名的撒马耳干织品，生产出供整个中亚的商人使用的帐篷。在锅商区内还出售各种铜器和精制的酒具，鞍具商区出售各种皮革马具，从喀什噶尔到设拉子，人们常常是争相购买来自