圣魂学院之内，主要大致可以划分为两个部分，位于山谷后半段的就是那一间间供学生居住的鳞次栉比的院落。[燃^文^书库][]而山谷前半段则是由中央校场、四栋藏经楼、练功密室，以及分别代表四大派系的青龙殿、白虎殿、朱雀殿和玄武殿组成。
其中中央校场位于最中央，其结构与金陵城中的圣魂武场很像，但规模却远远没有圣魂武场那么庞大，校场中央是方圆数百米的青石铺成的练功台，而在练功台的四周则是观战台，只不过校场的观战台只有正北方的位置才有座位，因为那里是供给院长和导师们观战的地方，而其余的三个方向则全部都是阶梯式的站台，以供各院的学生观战。
而位于校场西侧的便是纵向排列的四栋同为三层高的藏经楼，它们分别隶属于学院的四大派系，里面放着的正是各院常年积攒下来的功法与魂法秘籍，而学院内的藏经楼和宗门内的藏经楼地位是一样的，都是最为神圣的地方，可以说藏经楼内所存放的东西，是足以让整个圣域大陆所有的修武者都窥伺的宝贝，因此藏经楼也是圣魂学院中最大的禁地，除非有学院的导师带着，否则任何人也不能擅自进入藏经楼内。
在校场的东侧练功密室，分别是十间大密室和其后面的一百间小密室