2008年，克莱汤普森进入华盛顿州立大学。
200809赛季，克莱汤普森以首发身份打满了33场比赛，场均得到125分，三分球命中率和罚球命中率均位居全队之首，入选大十区年度最佳新秀阵容。
200910赛季，克莱汤普森场均得到196分，名列大十区第二位，成为校队历史上个人总得分达到1000分的第三快球员，入选大十区年度最佳阵容一队，并获得约翰伍登奖季中提名。在大阿拉斯加挑战赛中，汤普森轰下创纪录的43分并当选为最杰出球员单场43分也是华盛顿州大队史单场第三高纪录。
201011赛季，克莱汤普森场均得到216分成为大十区首席得分手，赛季733分的总得分创队史纪录，在队史总得分榜单上排名第三，再次入选大十区最佳阵容一队，成为队史第三位两度入选分区第一阵容的球员，此外，汤普森还是队史首个单赛季三次赢得周最佳的球员。2011年大十区锦标赛，汤普森投中8个三分轰下43分创锦标赛纪录。
而进入联盟之后，他也很快便打响了自己的名号。2012年5月23日，nb官方公布了201112赛季最佳新秀阵容入围名单，勇士新秀克莱汤普森入选第一阵容。