令京师全城戒严，内城九门全部封闭，外城七门也同样封闭，京师刑部、顺天府、锦衣卫、东厂、西厂等衙门衙役全部上街巡视，严禁百姓出门乱逛，凡有通敌嫌疑之人，统统缉拿关进诏狱，等敌军退走之后再另行甄别。
其次是部署京师防务。虽然根据情报指向，敌军攻击的重点在东南的广渠门和西北的德胜门。然而皇太极用兵灵活诡异，为防止他一时攻击不顺，便转而攻击京师其他城门，因此京师驻军要全部上城墙守护，吃喝全部都留在城墙上，不能有片刻疏忽。
其中徐光启、孙元化主管京师城墙火器事宜，除去空设在城墙之上假、坏、不能使用的火器之外，其余火枪、火炮要充分支援在城下作战的袁崇焕、满桂等部。
然后又传令德胜门外的满桂、广渠门外的袁崇焕严阵以待，做好同满洲兵马决战的准备。同时命令驻扎在三河的昌平总兵尤世威做好准备，随时接应配合袁崇焕的行动。
至于姬庆文所部五百精兵，孙承宗则多留了个心眼，不想让他们在此战之中便用皇太极的精锐硬拼硬耗，便令其继续在外城之内休整，只调拨两百火枪手，上广渠门城墙为袁崇焕助威助战。
这样的安排有失公平，未免有些私心，然而朝廷里有头有脸