家无意中发现，如果染有梅毒的病人感染疟疫，一但疟疫治好了，梅毒也就不治而愈，如此，他便想到了以毒攻毒的办法，用疟疫治梅毒，先让病人感染疟疫，然后再用他的秘药治好病人的疟疫，如此一来，病人也就能够痊愈了。”
其实这并不是疟疾杀死了梅毒，是因为疟疾发热，梅毒病毒不能耐受高温，达到了临床治愈，因为梅毒没有其他有效治疗方法，而疟疾已经有了治疗方法，所以才有了这种“以毒攻毒”的方法。而这种疟疾发热法治疗神 经梅毒一直沿用到青霉素的诞生。
“令、令师可真是当世之贤，居然能想到如此鬼神 手段治疗恶疫，若，若是当年大疫于中原横行时，令师若在，中原也不至于千里无人烟，无论军民皆为大疫所感，甚至就连神 京，当年若有令师……又岂会落入闯贼之手？”
方以智之所以会如此感叹，是因为崇祯时期北方的鼠疫流行，实际上，明末从万历年间就不断爆发区域性鼠疫，只是没有大范围扩散罢了。单一地区发生的鼠疫很快随着流民、农民军和迁徙鼠群被传染转移至其他地区，疫情由此急剧扩大，最终彻底失控。到闯贼进入京城的时候，鼠疫流行下的京城已经是十室九空了。即便是幸存者，也因为鼠疫后遗症导致守军体质羸