但这并不意味着没有“哭庙案”，实际上，在兴乾三年废除科举时，同样也有“哭庙案”。
“哭庙”是苏州一带流传已久的习俗。当地经济发达，人文荟萃，来自殷实之家、读书人成为一股重要的社会监察力量，当官府有不法之事不当之举，士子们每每聚集文庙，作《卷堂文》，向祖师爷孔圣人哭诉后，更召集民众向上级官府申告，在明朝，人多势众的“哭庙”申告往往能令官府不敢小视而采纳。但是在新朝老皇历撞了南墙。在朝廷诏示天下废除科举时，苏州同样也上百名秀才“哭庙”，不过与另一个顺治十八年的“哭庙案”导致包括十八名举人、秀才在内的一百二十一人被杀不同。这一百九十多名秀才，被以“聚众闹事”为由革除功名，流放海外。
对于此，人们或许惊讶于兴乾朝的“严苛”，但是相比满清的暴虐，已经让他们长松了一口气，毕竟，当初包括已经出仕的朱章培都以为，那些人至少带头的会被斩首。
不过，也正是从那个时候，朝廷明确的告诉天下的读书人，他们可以在报纸上发表文章表明意见，也可以通过正规渠道递交请愿书，但是想用“哭庙”申告的方式要胁官府，那是绝不可能接受的。即便是有理，也要先追究其违法行为之后，再处置