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除此之外，之前调入南方的两万多边军，也是尽数归属他的统辖之下！
威震了江南官场，把威望肃立起来后，他也是开始整顿军务了！
而有意思 的是，王以旗整顿军务的手段其实和张岳相当的类似，也是造枪炮练新军，当然了，他采取的方法要更加折中一些，他并没有和张岳那样直接编练督标，把卫所兵一股脑给变成了工人和屯垦的农民。
他首先做的是武装边军！
没有来到江南之前，他就是看过不少关于南方军务的文书，深知现在打仗靠着刀剑已经是不行了，得有枪炮才行，所以他到江南的第一件事，就是给现有的两万多边军换上枪炮等装备。
此外，他开始在各地方卫所里抽调精干，再招募一部分募兵补充，效仿张岳的督标，组成了‘江南新军’，然后用新式军队的方式进行编练和训练，至于老弱也没有裁汰，而是让他们继续在地方卫所里该干嘛干嘛。
当然了，实际成效如何就不是外人能够知道的了，至少在打一仗之前，谁也不知道他的方法到底好不好用，但是他到江南不过一个月，在十二月份给正德皇帝上书的时候，就已经是宣传，如今江南各省，已经陈兵三十余万，皆备枪炮，利刃厚