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科技，现代化，机械，钢铁……
一切的一切逐步将原来美丽而多彩的世界变得冰冷而无趣，人类的欲望没有止境，战争，掠夺，杀害，将这个世界染上悲惨的色彩，火焰在森林燃烧，导弹爆炸掀起海浪，黑烟尘埃布满了天空。
终于……人类的母亲地球，愤怒了，从海底出现的神秘舰队群，摧毁了人类的一切。
深海栖舰，这是人类对她们的称呼，从驱逐舰级到超弩级大型战舰，在深海栖舰多种多样的攻击下从制海权开始，人类逐渐丧失了一切。
人类的舰队被击毁，卫星被不知名的力量放逐向宇宙，最终，人类只能躲在大陆深处，苟延残喘。
然而，母亲终究是仁慈的，会对做错事的孩子惩罚，却也一定不会让孩子过于受伤，地球母亲也是一样，在诞生出深海栖舰这样能够毁灭人类的怪物同时，也给了人类能够与之对抗的唯一存在。
那就是拥有昔日战舰之魂的少女，舰娘！
诞生于各种战舰之上，与人类一样的外表，然而却拥有人类所没有的强大身体，拥有人类所没有的力量，于此同时……也拥有对人类这一种族的挚爱与忠诚。
这份感情，或许就是她们诞生于那些战舰的