。在这期间。成百上千的探测器被发射了出去，变成了一组组详细的数据传了回来。
但是这些数据反应的结果却越来越悲观，按照这些数据还原出的宇宙环境，之前设计建造的那些移民船根本就没有逃出去的可能。于是，之前的设计方案被一次次推翻，新一轮的方案再次开启，博多格人开始了新一轮的建造热潮。
就在所有的一切都走向正轨时，一颗小型黑洞被黑洞群吞噬，由此产生了远超以往的伽马射线暴。博多格人在星球表面抛洒的防护盾像一层旧报纸一般被捅破了，高速粒子流不仅击穿了防护层，甚至一部分还穿透了星球的地核，从另一边飞了出去，离开前还吹飞了星球上的大气层。
博多格人再次进入了危机中，百分之九十以上的地下城市被摧毁，地下城市所有人都被杀死。不仅仅是人，一切具有生命的东西都不存在了。只有最近建造的位于地幔深处的几座地下城幸存了下来，但是这些人也大多得了轻微的辐射病，生存状况堪忧。
人口锐减、食物不足、生态环境恶化、新生儿畸形……困难的情况迫使博多格人再次发生转变。在这个过程中，他们尝试了生物技术，结果导致了生化危机。他们尝试了信息技术，结果导致了智能叛变。剿灭智能叛变的战争摧